К научно-исследовательской деятельности, осуществляемой в заповедниках и национальных парках, относятся:
К научно-технической деятельности заповедников и национальных парков относятся:
Приоритетными направлениями научно технической деятельности являются: составление аннотированных списков видов сосудистых растений, позвоночных животных, фоновых семейств доминирующих отрядов беспозвоночных животных с периодичностью не менее 1 раза в 10 лет; осуществление комплексного экологического мониторинга природной среды; геоботаническое картирование территории; создание и актуализация геоинформационных систем и ведение баз данных, полученных в ходе инвентаризации и мониторинга природных ресурсов.
В качестве приоритетов прикладных научных исследований и экспериментальных разработок принято считать изучение экологии и проведение оценки состояния популяций редких видов растений и животных, ценных охотничье-промысловых видов животных, иных видов, имеющих существенную хозяйственную значимость. К прикладным исследованиям относится также научное обеспечение организации экологического просвещения и экологического туризма.
В Саяно-Шушенском заповеднике осуществляются научные исследования в области ботаники, зоологии, фенологии, почвоведения, направленные на изучение природных комплексов и объектов заповедника, долговременное слежение за динамикой природных процессов с целью оценки и прогноза экологической обстановки, разработки научных основ охраны природы, сохранения биологического разнообразия и предотвращения ущерба экосистемам заповедника. Отдельной темой проводится экологический мониторинг влияния Саяно-Шушенского водохранилища на экосистемы заповедной территории.
В тематическом плане научных исследований заповедника 5 основных тем.